该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Beadarray。
生物导体版本:3.7
该软件包能够读取BeadScan输出的珠级数据(原始TIFFS和文本文件)以及Beadstudio的珠子 - 萨华数据。提供了质量评估和低级分析的方法。
作者:马克·邓宁,迈克·史密斯,乔纳森·凯恩斯,安迪·林奇,马特·里奇
维护者:马克·邓宁(Mark Dunning)
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ beadarray”)
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Browsevignettes(“ Beadarray”)
R脚本 | beadarray.pdf | |
R脚本 | Beadlevel.pdf | |
R脚本 | Beadsummary.pdf | |
R脚本 | ImageProcessing.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 微阵列,,,,Onechannel,,,,预处理,,,,QualityControl,,,,软件 |
版本 | 2.30.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.8(R-2.3)(12。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | r(> = 2.13.0),生物基因(> = 0.3.2),生物酶(> = 2.17.8),方法,GGPLOT2 |
进口 | Beaddatapackr,,,,林玛,,,,AnnotationDbi,stats4,RESHAPE2,,,,基因组机,,,,iranges,,,,Illuminaio |
链接 | |
建议 | Lumi,,,,VSN,,,,副词,,,,HWRITER,,,,Beadarrayexampledata,,,,Illuminahumanv3.db,,,,栅格,,,,生物使用,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,GGBIO,,,,喷嘴.r1,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Beadarrayexampledata |
进口我 | ArrayQualityMetrics,,,,Beadarrayusecases,,,,Blima,,,,Epgenomix |
建议我 | Beadarraysnp,,,,blimatestingdata,,,,Lumi |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | beadarray_2.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | beadarray_2.30.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Beadarray_2.30.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beadarray |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/beadarray |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/beadarray/ |
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