bamsignals
doi：10.18129/b9.bioc.bamsignals
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅bamsignals。
从BAM文件中提取读取计数信号
生物导体版本：3.7
该软件包允许从索引的BAM文件有效地获得计数向量。它计算给定基因组范围中的读取数量，并计算读取曲线和覆盖率。它还处理配对端数据。
作者：Alessandro Mammana [AUT，CRE]，Johannes Helmuth [aut]
维护者：Alessandro Mammana
引用（从r内，输入引用（“ BamSignals”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ bamsignals”）
文档
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Browsevignettes（“ Bamsignals”）
| html | R脚本 | BamSignals包装简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，覆盖范围，，，，DataImport，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.12.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.1（R-3.2）（3.5岁） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | r（> = 3.2.0） |
| 进口 | 方法，生物基因，，，，RCPP（> = 0.10.6），iranges，，，，基因组机，，，，Zlibbioc |
| 链接 | RCPP，，，，Rhtslib（> = 1.12.1），Zlibbioc |
| 建议 | 测试（> = 0.9），rsamtools，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Aneufinder，，，，Chromstar，，，，NORMR |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | bamsignals_1.12.1.tar.gz |
| Windows二进制 | bamsignals_1.12.1.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | bamsignals_1.12.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bamsignals |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/bamsignals |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/bamsignals/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
