此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见舞会礼服.
Bioconductor版本:3.7
组合转录组的统计分析工具,包括灵活的差异表达分析,转录本结构的可视化,以及组合转录本与注释的匹配。
作者:Jack Fu [aut], Alyssa C. Frazee [aut, cre], Leonardo Collado-Torres [aut], Andrew E. Jaffe [aut], Jeffrey T. Leek [aut, ths]
维护者:Jack Fu
引文(从R内,输入引用(“舞会礼服”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“球袍”)
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browseVignettes(“舞会礼服”)
超文本标记语言 | R脚本 | 用Ballgown进行灵活的异构体水平差异表达分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,预处理,RNASeq,软件,StatisticalMethod |
版本 | 2.12.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(四年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.1.1),方法 |
进口 | GenomicRanges(> = 1.17.25),IRanges(> = 1.99.22),S4Vectors(> = 0.9.39),RColorBrewer样条函数,股东价值分析,limma,rtracklayer(> = 1.29.25),Biobase(> = 2.25.0),GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | testthat,knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/alyssafrazee/ballgown/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | 聚酯,variancePartition |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ballgown_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | ballgown_2.12.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | ballgown_2.12.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ballgown |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ballgown |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ballgown/ |
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