apeglm

DOI:10.18129 / B9.bioc.apeglm

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见apeglm．

GLM系数的近似后验估计

Bioconductor版本:3.7

apeglm为各种GLM模型的效应大小提供贝叶斯收缩估计，使用个体系数的后验逼近。

作者:朱安琪，Joseph G. Ibrahim, Michael I. Love

维护者:Anqi Zhu < Anqi Zhu at live.unc.edu>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“apeglm”)

文档

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browseVignettes(“apeglm”)

超文本标记语言	R脚本	用apeglm估计效应量
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯，DifferentialExpression，GeneExpression，RNASeq，测序，软件
版本	1.2.1 "
许可证	GPL-2
取决于
进口	emdbook，SummarizedExperiment，GenomicRanges，方法，统计，utils，Rcpp
链接	Rcpp，RcppEigen，RcppNumerical
建议	DESeq2，气道，knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	rnaseqGene
进口我
建议我	DESeq2
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	apeglm_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	apeglm_1.2.1.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	apeglm_1.2.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/apeglm
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/apeglm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/apeglm/
软件包下载报告	下载数据