高山

DOI:10.18129 / B9.bioc.alpine

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅高山。

高山

Bioconductor版本:3.7

片段序列偏差建模和修正RNA-seq转录丰度估计。

作者:迈克尔·爱,拉斐尔•伊

维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >

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HTML	R脚本	高山
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文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,BatchEffect,报道,DifferentialSplicing,GeneExpression,归一化,质量控制,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.3)
进口	Biostrings,IRanges,GenomicRanges,GenomicAlignments,Rsamtools,SummarizedExperiment,GenomicFeatures,speedglm样条函数,图,RBGL,stringr、数据、方法、图形GenomeInfoDb,S4Vectors
链接
建议	knitr,testthat,alpineData,rtracklayer,ensembldb,BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38,RColorBrewer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	alpine_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	alpine_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	alpine_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alpine
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/高山
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/alpine/
包下载报告	下载数据