affyILM

DOI:10.18129 / B9.bioc.affyILM

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见affyILM

背景减法的线性模型和朗缪尔等温线

Bioconductor版本:3.7

affyILM是一种预处理工具,用于估计Affymetrix基因芯片的基因表达水平。来自物理化学的输入被用于第一个背景减去强度,然后代表朗缪尔模型计算浓度。

作者:K.米利亚姆·克罗尔,法布里斯·伯杰,杰拉德·巴科玛,恩里科·卡隆

维护者:Myriam Kroll和Fabrice Berger < Fabrice。伯杰在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“affyILM”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“affyILM”)

文档

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browseVignettes(“affyILM”)

PDF R脚本 affyILM1.3.0
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列OneChannel预处理软件
版本 1.32.0
在Bioconductor BioC 2.6 (R-2.11)(8.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 2.10.0),方法,gcrma
进口 affxparser(> = 1.16.0),affy、图形、Biobase
链接
建议 AffymetrixDataTestFileshgfocusprobe
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 affyILM_1.32.0.tar.gz
Windows二进制 affyILM_1.32.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) affyILM_1.32.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affyILM
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/affyILM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/affyILM/
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