acde

DOI:10.18129 / B9.bioc.acde

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见acde

差异表达基因的人工成分检测

Bioconductor版本:3.7

该软件包为检测基因表达数据中的差异表达基因提供了一种多元推理分析方法。它使用人工成分,接近数据的主成分,但在差异基因表达方面有准确的解释,以识别差异表达基因,同时控制错误发现率(FDR)。此包中的方法在小插图或J. P. Acosta, L. Lopez-Kleine和S. Restrepo(2015年,待发)的文章“基因表达实验中差异表达基因推断鉴定的多元方法”中描述。

作者:Juan Pablo Acosta, Liliana Lopez-Kleine

维护者:Juan Pablo Acosta

引文(从R内,输入引用(“acde”)):

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“acde”)

文档

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browseVignettes(“acde”)

PDF R脚本 人工成分差异表达基因的鉴定
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpression微阵列PrincipalComponent软件TimeCoursemRNAMicroarray
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3),引导(> = 1.3)
进口 统计数据、图形
链接
建议 BiocGenericsRUnit
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

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源包 acde_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 acde_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) acde_1.10.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/acde
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/acde
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/acde/
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