该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅yapsa。
生物导体版本:3.7
该软件包提供了有用的功能和例程,可用于分析躯体特征(参见L. Alexandrov等人,自然2013)。特别是,提供了具有已知特征(LCD =线性组合分解)的签名分析的功能,并提供了对分层突变目录(SMC =分层突变目录)的签名分析。
作者:Daniel Huebschmann,Zuguang Gu,Matthias Schlesner
维护者:Daniel Huebschmann
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html | R脚本 | yapsa |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物问题,,,,聚类,,,,dnaseq,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,统计信息,,,,可视化 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.4(R-3.3)(2年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.0),基因组机,,,,GGPLOT2, 网格 |
进口 | lsei,,,,躯体签名,,,,变体,,,,GenomeInfodB,,,,RESHAPE2,,,,栅格,,,,Corrplot,,,,Dendextend,,,,getoptlong,,,,循环,,,,Gtrellis,,,,PMCMR,,,,复杂的图像,,,,keggrest,grdevices |
链接 | |
建议 | bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | yapsa_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | yapsa_1.6.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | yapsa_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yapsa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/yapsa |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/yapsa/ |
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