yapsa

doi:10.18129/b9.bioc.yapsa

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅yapsa

还有另一个用于签名分析的软件包

生物导体版本:3.7

该软件包提供了有用的功能和例程,可用于分析躯体特征(参见L. Alexandrov等人,自然2013)。特别是,提供了具有已知特征(LCD =线性组合分解)的签名分析的功能,并提供了对分层突变目录(SMC =分层突变目录)的签名分析。

作者:Daniel Huebschmann,Zuguang Gu,Matthias Schlesner

维护者:Daniel Huebschmann

引用(从r内,输入引用(“ Yapsa”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ yapsa”)

文档

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Browsevignettes(“ Yapsa”)

html R脚本 yapsa
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 生物问题,,,,聚类,,,,dnaseq,,,,基因组变量,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,统计信息,,,,可视化
版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(2年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.0),基因组机,,,,GGPLOT2, 网格
进口 lsei,,,,躯体签名,,,,变体,,,,GenomeInfodB,,,,RESHAPE2,,,,栅格,,,,Corrplot,,,,Dendextend,,,,getoptlong,,,,循环,,,,Gtrellis,,,,PMCMR,,,,复杂的图像,,,,keggrest,grdevices
链接
建议 bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 yapsa_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 yapsa_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) yapsa_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yapsa
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/yapsa
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/yapsa/
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