Xbseq.

DOI：10.18129 / b9.bioc.xbseq.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Xbseq.。

测试RNA-SEQ数据的差异表达

生物导体版本：3.7

我们开发了一种新颖的算法XBSeq，其中基于观察到的信号是真实表达信号和测序噪声的卷积的假设来建立统计模型。非偏振区域中的映射读数被认为是测序噪声，其遵循泊松分布。给定来自RNA-SEQ数据的可测量和噪声信号，假设由负二氯分布控制的真实表达信号，可以描绘，因此精确地检测差异表达基因。

作者：刘元汉

维护者：袁杭刘<威瑞12，在uthscsa.edu>

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BROWSEVIGNETTES（“XBSEQ”）

HTML.	r script.	使用XBSEQ包的计数数据差异表达和APA使用分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	不同的亚兴那实验设计那rnaseq.那测序那软件
版本	1.12.0
在生物导体中以来	BIOC 3.2（R-3.2）（3年）
执照	GPL（> = 3）
依靠	deseq2.，r（> = 3.3）
进口	Pracma.那MatrixStats.那Locfit.那ggplot2.， 方法，BioBase.那dplyr.那Magrittr.那怒吼
链接到
建议	kn那DESEQ.那RAMAMAMDOW.那生物焦那testthat.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/liuy12/xbseq.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	xbseq_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件	xbseq_1.12.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	xbseq_1.12.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/xbseq.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ xbseq
包短网址	http://biocidodder.org/packages/xbseq/
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