TransView

DOI:10.18129 / B9.bioc.TransView

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TransView

阅读密度图的构建和添加。ChIPSeq和RNASeq数据集的可视化

Bioconductor版本:3.7

该软件包提供了高效的工具来生成、访问和显示基于测序的数据集(如RNA-Seq和ChIP-Seq)的读密度。

作者:尤利乌斯•穆勒

维护者:Julius Muller

引用(从R中,输入引用(“TransView”)):

安装

要安装这个包,开始R,然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("TransView")

文档

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browseVignettes(“TransView”)

PDF R脚本 介绍TransView
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq聚类DNAMethylationDataImportGeneExpressionMethylSeq微阵列MultipleComparisonRNASeq测序软件转录可视化
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 方法,GenomicRanges
进口 BiocGenericsS4Vectors(> = 0.9.25),IRangesRsamtools(> = 1.19.38),zlibbiocgplots
链接 Rsamtools
建议 RUnitpasillaBamSubset
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/TransView.html
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 TransView_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 TransView_1.24.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan) TransView_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TransView
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TransView
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TransView/
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