此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本,请参见TransView.
Bioconductor版本:3.7
该软件包提供了高效的工具来生成、访问和显示基于测序的数据集(如RNA-Seq和ChIP-Seq)的读密度。
作者:尤利乌斯•穆勒
维护者:Julius Muller
引用(从R中,输入引用(“TransView”)
):
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##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("TransView")
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browseVignettes(“TransView”)
R脚本 | 介绍TransView | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ChIPSeq,聚类,DNAMethylation,DataImport,GeneExpression,MethylSeq,微阵列,MultipleComparison,RNASeq,测序,软件,转录,可视化 |
版本 | 1.24.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.11 (R-2.15)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | 方法,GenomicRanges |
进口 | BiocGenerics,S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,Rsamtools(> = 1.19.38),zlibbioc,gplots |
链接 | Rsamtools |
建议 | RUnit,pasillaBamSubset |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/TransView.html |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | TransView_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | TransView_1.24.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | TransView_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TransView |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ TransView |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/TransView/ |
包下载报告 | 下载数据 |