Titancna

doi:10.18129/b9.bioc.titancna

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Titancna

从肿瘤的整个基因组测序中的亚克隆拷贝数和LOH预测

生物导体版本:3.7

隐藏的马尔可夫模型以细分和预测亚克隆拷贝数改变(CNA)和杂合性丧失(LOH)的区域,并估计肿瘤整个基因组测序数据中克隆簇的细胞cluronece。

作者:Gavin HA,Sohrab P Shah

维护者:broadinstitute.org>的gavin ha

引用(从r内,输入引用(“ titancna”)):

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文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,遗传学,,,,基因组变量,,,,HiddenMarkovModel,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,全媒体
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 2.14(R-3.1)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.2)
进口 iranges(> = 2.6.1),基因组机(> = 1.24.3),变体(> = 1.18.7),foreach(> = 1.4.3),rsamtools(> = 1.24.0),GenomeInfodB(> = 1.8.7),Data.Table(> = 1.10.4),dplyr(> = 0.5.0)
链接
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URL https://github.com/gavinha/titancna
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源包 titancna_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 titancna_1.18.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) titancna_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/titancna
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/titancna
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/titancna/
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