该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅Titancna。
生物导体版本:3.7
隐藏的马尔可夫模型以细分和预测亚克隆拷贝数改变(CNA)和杂合性丧失(LOH)的区域,并估计肿瘤整个基因组测序数据中克隆簇的细胞cluronece。
作者:Gavin HA,Sohrab P Shah
维护者:broadinstitute.org>的gavin ha
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R脚本 | titancna.pdf | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,遗传学,,,,基因组变量,,,,HiddenMarkovModel,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,全媒体 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.14(R-3.1)(4。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.2) |
进口 | iranges(> = 2.6.1),基因组机(> = 1.24.3),变体(> = 1.18.7),foreach(> = 1.4.3),rsamtools(> = 1.24.0),GenomeInfodB(> = 1.8.7),Data.Table(> = 1.10.4),dplyr(> = 0.5.0) |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/gavinha/titancna |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | titancna_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | titancna_1.18.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | titancna_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/titancna |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/titancna |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/titancna/ |
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