TargetScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.TargetScore

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见TargetScore．

TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标

Bioconductor版本:3.7

通过概率模拟microRNA过表达折叠变化的可能性和基于序列的分数，推断microRNA目标的后验分布。采用变向贝叶斯高斯混合模型(VB-GMM)记录折叠变化和序列分数，得到潜在变量作为miRNA靶标的后验。最终的targetScore计算为sigmoid转换的折叠变化，由所有特征的目标组件的平均后视进行加权。

作者:李越

维护者:Yue Li

安装

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文档

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PDF	R脚本	TargetScore:使用microRNA过表达数据和序列信息推断microRNA目标
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文本		新闻

细节

biocViews	软件，microrna的
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	pracma，矩阵
进口
链接
建议	TargetScoreData，gplots，Biobase，GEOquery
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cs.utoronto.ca/~yueli/software.html
全靠我
进口我
建议我	TargetScoreData
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	TargetScore_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	TargetScore_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TargetScore_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TargetScore
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TargetScore
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TargetScore/
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