TarSeqQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TarSeqQC

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见TarSeqQC

定向测序实验质量控制

Bioconductor版本:3.7

该包允许用r来表示目标实验。这是基于当前的包,并包含了对这类实验进行质量控制和快速探索排序区域的功能。生成一个xlsx文件作为输出。

作者:Gabriela A. Merino, Cristobal Fresno, Yanina Murua, Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者:Gabriela Merino <美利奴。Gabriela33在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“TarSeqQC”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“TarSeqQC”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“TarSeqQC”)

PDF R脚本 TarSeqQC:靶向测序实验质量控制
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐报道DataImport质量控制测序软件TargetedResequencing可视化
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 3.4.1),方法,GenomicRangesRsamtools(> = 1.20.4),ggplot2plyropenxlsx
进口 grDevices, stats, utils,S4VectorsIRangesBiocGenericsreshape2GenomeInfoDbBiocParallelBiostringscowplot、图形、GenomicAlignmentsHmisc
链接
建议 RUnit
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.ar
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 TarSeqQC_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 TarSeqQC_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) TarSeqQC_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TarSeqQC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TarSeqQC
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/TarSeqQC/
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Bioconductor

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