tfea.chip.

DOI:10.18129 / b9.bioc.tfea.chip.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅tfea.chip.

分析转录因子富集

生物导体版本:3.7

用来自芯片-SEQ实验的数据进行分析在基因中的转录因子富集。

作者:Laura PuenteSantamaría,路易斯德尔比索

维护者:Laura PuenteSantamaría>

引文(从R内,输入引文(“TFEA.CHIP”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url源(“https://biocumon.org/bioclite.r”)bioclite(“tfea.chip”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“TFEA.CHIP”)

HTML. r script. 小插图标题
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. chipseq.GenereGulation.GenesetenRichment.rnaseq.测序软件转录转录组学
版本 1.0.0.
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.5),dplyr.txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.org.hs.eg.db.
进口 Genomicranges.绞喉生物雕基因组法,grdevices,stats,utils,R.utils.
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.S4Vectors.情节Tidyr.ggplot2.GSEABASE.deseq2.生物根系
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 tfea.chip_1.0.0.tar.gz.
Windows二进制文件 tfea.chip_1.0.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) tfea.chip_1.0.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/tfea.chip.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocumon.org:包/ tfea.chip
包短网址 http://biocidodder.org/packages/tfea.chip/
包裹下载报告 下载统计信息

文件»

生物体

R./cr包裹和文件

支持»

请阅读张贴指南。将关于Biocometiond的问题发布到以下位置之一:

  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • 正常词 邮件列表 - 适用于包开发人员bob电竞体育官网