TEQC

DOI:10.18129 / B9.bioc.TEQC

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见TEQC．

目标捕获实验的质量控制

Bioconductor版本:3.7

目标捕获实验结合了基于杂交的(在溶液中或微阵列上)捕获和富集感兴趣的基因组区域(例如外显子组)，并对捕获的DNA片段进行高通量测序。该包提供了用于评估和可视化目标富集过程质量的功能，如捕获的特异性和敏感性，每个目标读取覆盖率等等。

作者:M. Hummel, S. Bonnin, E. Lowy, G. Roma

维修工:Manuela Hummel

安装

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文档

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PDF	R脚本	TEQC
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学，微阵列，质量控制，测序，软件
版本	4.2.0
在Bioconductor	BioC 2.8 (R-2.13)(7.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法,BiocGenerics(> = 0.1.0),IRanges(> = 1.13.5),Rsamtools，hwriter
进口	Biobase(> = 2.15.1)
链接
建议
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增强了
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进口我
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构建报告

包档案

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源包	TEQC_4.2.0.tar.gz
Windows二进制	TEQC_4.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	TEQC_4.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/TEQC
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/TEQC
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/TEQC/
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