此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见彩带.
Bioconductor版本:3.7
在R中处理大数据文件可能很困难,因为R中的数据通常驻留在内存中。这个包鼓励一种编程风格,即数据通过“生产者”和一系列“消费者”从磁盘“流”到R,通常将原始数据减少到可管理的大小。该包为数据输入、采样、索引和转换等操作提供了有用的生产者和消费者流组件;看到包吗?彩带for details.
作者:Martin Morgan, Nishant Gopalakrishnan
维护者:马丁·摩根<马丁。在roswellpark.org>
引文(从R内,输入引用(“流光”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Streamer”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“流光”)
R脚本 | Streamer:一个简单的例子 | |
参考手册 |
biocViews | DataImport,基础设施,软件 |
版本 | 1.26.0 |
在Bioconductor | BioC 2.9 (R-2.14)(7年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | |
进口 | 方法,图,RBGL平行,BiocGenerics |
链接 | |
建议 | RUnit,Rsamtools(> = 1.5.53),GenomicAlignments,Rgraphviz |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | plethy |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Streamer_1.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | Streamer_1.26.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Streamer_1.26.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Streamer |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Streamer |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Streamer/ |
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