SingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.SingleCellExperiment

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SingleCellExperiment。

S4单细胞数据类

Bioconductor版本:3.7

定义了一个从单细胞实验S4类来存储数据。这包括专门的方法来存储和检索信息激增,降维的坐标和尺寸因素对于每个单元格,还是和往常一样基因和库的元数据。

作者:亚伦Lun (aut (cph),大卫。Risso (cre, aut cph],基冈Korthauer(施)

维护人员:大卫Risso < Risso。大卫。gmail.com >

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HTML	R脚本	介绍SingleCellExperiment类
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,SingleCell,软件
版本	1.2.0
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5),SummarizedExperiment
进口	S4Vectors、方法、BiocGenerics,跑龙套
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,scRNAseq,magrittr,Rtsne
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	基础知识,clusterExperiment,DropletUtils,iSEE,桅杆,嘘,scPipe,食物,simpleSingleCell,singleCellTK,飞溅,switchde,TENxBrainData,zinbwave
进口我	BEARscc,ccfindR,LineagePulse,netSmooth,SC3,scDD,scfind,scmap,SCnorm,激流回旋
建议我	DEsingle,命运,phenopath,scFeatureFilter
我的链接
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SingleCellExperiment_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	SingleCellExperiment_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	SingleCellExperiment_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SingleCellExperiment
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ SingleCellExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SingleCellExperiment/
包下载报告	下载数据