SEQVARTOOLS.

DOI:10.18129 / b9.bioc.seqvartools.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅SEQVARTOOLS.

变体数据的工具

生物导体版本:3.7

在SEQARRAY中提供的VCF数据的快速访问存储格式的接口,具有用于共同操作和分析的工具。

作者:Stephanie M. Gogarten,Ziuwen Zheng,Adrienne Stilp

维护者:斯蒂芬妮M. Gogarten

引文(从R内,输入引文(“SEQVARTOOLS”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url source(“https://biocumon.org/bioclite.r”)Bioclite(“Seqvartools”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SEQVARTOOLS”)

PDF. r script. SEQVARTOOLS介绍
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 遗传性遗传学SNP.测序软件
版本 1.18.0.
在生物导体中以来 BIOC 2.13(R-3.0)(5年)
执照 GPL-3.
依靠 SEQARRAY.
进口 grdevices,图形,统计数据,方法,BioBase.GDSFMT.Genomicranges.绞喉S4Vectors.gwasexacthwLogistf.矩阵dplyr.Tidyr.
链接到
建议 生物根系生物焦运行stringr.
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包档案包

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源包 seqvartools_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 seqvartools_1.18.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) seqvartools_1.18.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/seqvartools.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ seqvartools
包短网址 http://biocidodder.org/packages/seqvartools/
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