Scale4C

DOI:10.18129 / B9.bioc.Scale4C

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见Scale4C．

Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换

Bioconductor版本:3.7

Scale4C是一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换和可视化。尺度空间变换是一种多尺度可视化技术，通过应用不同的平滑核(高斯，增加西格玛)，将二维信号(例如在基因组选择区间上的4C-seq读数)转换为尺度空间(2D，基因组位置x尺度因子)中的镶嵌。这种转换允许对数据的结构与其他样本进行探索性分析和比较。

作者:卡罗琳·沃尔特

维护者:Carolin Walter < Carolin。沃尔特在uni-muenster.de>

安装

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PDF	R脚本	Scale4C:一个R/Bioconductor包，用于4C-seq数据的尺度空间转换
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，DataImport，质量控制，测序，软件，可视化
版本	1.2.0
许可证	LGPL-3
取决于	R (>= 3.4)，奶昔，GenomicRanges，IRanges，SummarizedExperiment
进口	方法，grDevices，图形，utils
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	Scale4C_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	Scale4C_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Scale4C_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Scale4C
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Scale4C
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Scale4C/
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