Strome4.

DOI:10.18129 / b9.bioc.stroma4.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Strome4.

将属性分配给TNBC患者

生物导体版本:3.7

该包装估计在基因表达数据集的每位患者的TNBC患者中鉴定的四个基质性质。这些基质性质分配可以组合给亚型患者。在三阴性乳腺癌(TNBC)患者中鉴定了这四种基质性质,并且代表了基质中不同细胞的存在:T细胞(T),B细胞(B),基质浸润上皮细胞(E)和DESMOLESIA(d)。此外,该包装还可用于估计Lehmann亚型的生成特性,替代TNBC亚型方案(PMID:21633166)。

作者:Sadiq Saleh [Aut,Cre],Michael Hallett [Aut]

维护者:Sadiq Saleh

引文(从R内,输入引文(“Strome4”)):

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细节

Biocviews. BioMeDicalInformatics分类基因表达微阵列rnaseq.软件
版本 1.4.0.
在生物导体中以来 BIOC 3.5(R-3.4)(1.5年)
执照 GPL-3.
依靠 r(> = 3.4),BioBase.生物相投MatrixStats.,统计,图形,ilils
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源包 stroma4_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件 stroma4_1.4.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) stroma4_1.4.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/stroma4.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包/ stroma4
包短网址 http://biocidodder.org/packages/stroma4/
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