StringDB

doi:10.18129/b9.bioc.stringdb

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅StringDB

StringDB(用于检索相互作用蛋白数据库的搜索工具)

生物导体版本:3.7

StringDB软件包为String蛋白 - 蛋白质交互数据库(http://www.string-db.org)提供了R接口。

作者:Andrea Franceschini

维护者:Damian Szklarczyk

引用(从r内,输入引用(“ StringDB”)):

安装

要安装此软件包,请启动R并输入:

##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ stringdb”)

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ StringDB”)

PDF R脚本 StringDB Vignette
PDF 参考手册

细节

生物浏览 网络,,,,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 2.14.0)
进口 PNG,,,,SQLDF,,,,plyr,,,,Igraph,,,,rcurl, 方法,rcolorbrewer,,,,GPLOTS,,,,哈希,,,,plotrix
链接
建议 运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我 ppinfer,,,,SCSR
进口我 coexnet,,,,我是男人,,,,杂种,,,,丽塔
建议我 Epinem,,,,GenEnetworkbuilder,,,,NetSmooth,,,,PCAN
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 StringDB_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 StringDB_1.20.0.ZIP
Mac OS X 10.11(El Capitan) StringDB_1.20.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stringdb
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/stringdb
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/stringdb/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • 正常词 邮件列表 - 包装开发人员bob电竞体育官网