分裂

DOI:10.18129 / B9.bioc.SPLINTER

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见分裂

文本的拼接解释器

Bioconductor版本:3.7

SPLINTER提供工具来分析可选剪接位点,根据序列信息解释结果,选择和设计引物进行位点验证,并给出事件的可视化表示来指导下游实验。

作者:Diana Low

维护者:Diana Low

引文(从R内,输入引用(“分裂”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“SPLINTER”)

文档

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browseVignettes(“分裂”)

PDF R脚本 分裂
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingGeneExpressionRNASeq软件可视化
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(2年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4.0), grDevices, stats
进口 图形,ggplot2seqLogoBiostringsbiomaRtGenomicAlignmentsGenomicRangesGenomicFeaturesGvizIRangesS4VectorsGenomeInfoDb跑龙套,plyrBSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SPLINTER_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 SPLINTER_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) SPLINTER_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/SPLINTER
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/SPLINTER
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SPLINTER/
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