SNPCHIP.

DOI:10.18129 / b9.bioc.snpchip.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅SNPCHIP.

复制号码更改的可视化

生物导体版本:3.7

绘制SNP阵列数据的功能;陷入历史原因

作者:robert scharpf 和ingo ruczinski

维护者:罗伯特Scharpf

引文(从R内,输入引文(“SNPCHIP”)):

安装

要安装此包,请启动R并输入:

##如果不支持HTTPS:// URL,请尝试http://源(“https://biocondudard.org/bioclite.r”)Bioclite(“snpchip”)

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SNPCHIP”)

PDF. r script. 绘制Idiograms.
PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 复印机遗传性SNP.软件可视化
版本 2.26.0
在生物导体中以来 BIOC 2.0(R-2.5)(11.5岁)
执照 LGPL(> = 2)
依靠 r(> = 2.14.0)
进口 方法,图形,格子, 网格,Foreach.,实用,BioBase.S4Vectors.(> = 0.9.25),绞喉Genomeinfodb.Genomicranges.概括分析oligoclasses.(> = 1.31.1)
链接到
建议 CRLMM.(> = 1.17.14),运行
系统要求
加强 Dosnow.香草(> = 1.21.24),rcolorbrewer.
URL. http://www.biostat.jhsph.edu/~ aruczins/software/snpchip.html.
取决于我 MBPCR.
进口我 CRLMM.现象
建议我 类别最小值oligoclasses.香草
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包 snpchip_2.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件 snpchip_2.26.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) snpchip_2.26.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/snpchip.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ snpchip
包短网址 http://biocidodder.org/packages/snpchip/
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