Risa.

DOI:10.18129 / b9.bioc.risa.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本,请参阅Risa.

将实验元数据从ISA-Tab转换为生物导体数据结构

生物导体版本:3.7

The Investigation / Study / Assay (ISA) tab-delimited format is a general purpose framework with which to collect and communicate complex metadata (i.e. sample characteristics, technologies used, type of measurements made) from experiments employing a combination of technologies, spanning from traditional approaches to high-throughput techniques. Risa allows to access metadata/data in ISA-Tab format and build Bioconductor data structures. Currently, data generated from microarray, flow cytometry and metabolomics-based (i.e. mass spectrometry) assays are supported. The package is extendable and efforts are undergoing to support metadata associated to proteomics assays.

作者:Alejandra Gonzalez-Beltran,Audrey Kauffmann,Steffen Neumann,Gabriella Rustici,Isa团队

维护者:Alejandra Gonzalez-Beltran

引文(从R内,输入引文(“RISA”)):

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PDF. r script. RISA:将实验元数据从ISA-Tab转换为生物导体数据结构
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细节

Biocviews. 注解DataImport.质谱软件
版本 1.22.0
在生物导体中以来 BIOC 2.11(R-2.15)(6年)
执照 LGPL.
依靠 r(> = 2.0.9),BioBase.(> = 2.4.0),方法,rcpp.(> = 0.9.13),Biocviews.敬服
进口 XCMS.
链接到
建议 FAAHKO.(> = 1.2.11)
系统要求
加强
URL. http://www.isa-tools.org/
Bugreports. https://github.com/isa-tools/risa/issues.
取决于我
进口我
建议我 mtbls2.
链接给我
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源包 Risa_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件 Risa_1.22.0.zip.
Mac OS x 10.11(El Capitan) RISA_1.22.0.TGZ.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/risa.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ risa
包短网址 http://biocumon.org/packages/risa/
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