此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见RUVSeq.
Bioconductor版本:3.7
该包实现了Risso等人(2014)的去除不需要的变异(RUV)方法,用于样本之间RNA-Seq读取计数的规范化。
作者:Davide Risso [aut, cre, cph], Sandrine Dudoit [aut], Lorena Pantano [ctb], Kamil Slowikowski [ctb]
维护者:Davide Risso < Risso。Davide在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“RUVSeq”)
):
要安装这个包,启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RUVSeq”)
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RUVSeq”)
R脚本 | RUVSeq:从RNA-Seq数据中去除不需要的变异 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialExpression,预处理,RNASeq,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(四年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | Biobase,EDASeq(> = 1.99.1),刨边机 |
进口 | 方法,质量 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,RColorBrewer,zebrafishRNASeq,DESeq2 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/drisso/RUVSeq |
BugReports | https://github.com/drisso/RUVSeq/issues |
全靠我 | rnaseqGene |
进口我 | 司康饼 |
建议我 | DEScan2 |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RUVSeq_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | RUVSeq_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RUVSeq_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RUVSeq |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RUVSeq |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RUVSeq/ |
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