rtnsurvival
doi：10.18129/b9.bioc.rtnsurvival
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅rtnsurvival。
使用RTN软件包推断出的转录网络的生存分析
生物导体版本：3.7
RTNSURVIVAL是将RTN软件包生成的监管与生存信息集成的工具。对于给定的调节子，2尾GSEA方法计算每个样品的差异分数（DES），然后使用所有样品的DES分布来评估同队的生存统计。有两个主要的生存分析工作流程：一种COX比例危害方法，用于模拟调节量作为生存时间的预测指标，以及基于调节活性的同类群体分层的Kaplan-Meier分析。所有图都可以按照用户的规格进行微调。
作者：Clarice S. Groeneveld，Vinicius S. Chagas，Mauro A. A. Castro
维护人员：clarice groeneveld
引用（从r内，输入引用（“ rtnsurvival”））：
安装
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##尝试http：//如果不支持https：// url不支持源（“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”）bioclite（“ rtnsurvival”）
文档
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browsevignettes（“ rtnsurvival”）
| html | R脚本 | RTNSurvival：使用转录网络和调节子进行多元生存分析。 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结肠管制，，，，基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，NetworkEnrichment，，，，网络引导，，，，软件，，，，生存 |
| 版本 | 1.4.5 |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5），RTN（> = 2.4.5），rtnduals（> = 1.4.4），方法 |
| 进口 | 生存，，，，rcolorbrewer，grdevices，图形，统计，utils，秤 |
| 链接 | |
| 建议 | Fletcher2013b，，，，pheatmap，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，运行，，，，生物基因 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rtnsurvival_1.4.5.tar.gz |
| Windows二进制 | rtnsurvival_1.4.5.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | rtnsurvival_1.4.5.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtnsurvival |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rtnsurvival |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rtnsurvival/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
