RTN
doi：10.18129/b9.bioc.rtn
该包适用于生物导体的3.7版；对于稳定的最新版本，请参阅RTN。
转录网络的重建和主监管机构的分析
生物导体版本：3.7
该软件包提供了转录网络推理和分析的类和方法。转录因子活性的调节剂通过条件相互信息评估，并使用不同的策略（例如基因集富集，阴影和协同作用分析）将主调节剂映射到表型。此外，使用EQTL/VSE分析可以将主调节剂与遗传标记链接，利用映射到人类基因组的单倍型块结构，以探索在GWAS研究中鉴定的风险相关的SNP。
作者：毛罗·卡斯特罗（Mauro Castro），Xin Wang，Michael Fletcher，Florian Markowetz和Kerstin Meyer
维护者：毛罗·卡斯特罗（Mauro Castro）
引用（从r内，输入引用（“ RTN”））：
安装
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文档
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| html | R脚本 | RTN：转录网络的重建和主监管机构的分析。” |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 基因表达，，，，结肠管制，，，，基因烯，，，，遗传因素，，，，GraphandNetwork，，，，NetworkEnrichment，，，，网络引导，，，，SNP，，，，软件 |
| 版本 | 2.4.6 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.13（R-3.0）（5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.3.3），方法 |
| 进口 | Reder，，，，模丝，，，，毒蛇，，，，混音工具，，，，雪，，，，林玛，，，，Data.Table，，，，iranges，，，，Igraph，，，，S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | 运行，，，，生物基因，，，，生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://dx.doi.org/10.1038/ncomms3464 |
| 取决于我 | Fletcher2013b，，，，rtnduals，，，，rtnsurvival |
| 进口我 | |
| 建议我 | Geneplast |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | rtn_2.4.6.tar.gz |
| Windows二进制 | rtn_2.4.6.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | rtn_2.4.6.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rtn |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rtn |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rtn/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
