RMassBank

DOI:10.18129 / B9.bioc.RMassBank

此包适用于Bioconductor的3.7版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RMassBank．

处理串联MS文件和构建MassBank记录的工作流

Bioconductor版本:3.7

处理串联MS文件和构建MassBank记录的工作流。功能包括串联质谱的自动提取，串联质谱片段的公式分配，用指定片段重新校准串联质谱，光谱清理，从互联网数据库自动检索化合物信息，以及导出到MassBank记录。

作者:Michael Stravs, Emma Schymanski, Steffen Neumann, Erik Mueller，由Tobias Schulze贡献

维护程序:RMassBank at Eawag

安装

要安装这个包，开始R，然后输入:

##尝试http://如果https:// url不支持source("//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R") biocLite("RMassBank")

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“RMassBank”)

PDF	R脚本	RMassBank非标准用法
PDF	R脚本	RMassBank使用XCMS演练
PDF	R脚本	RMassBank预排
PDF		参考手册

细节

biocViews	生物信息学，MassSpectrometry，代谢组学，软件
版本	2.8.0
在Bioconductor公司	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Rcpp
进口	XML，RCurl，rjson，S4Vectors，消化，rcdk，yaml，mzR、方法、Biobase，MSnbase
链接
建议	gplots，RMassBankData，xcms(> = 1.37.1),相机ontoCAT,RUnit，enviPat
SystemRequirements	OpenBabel
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	RMassBankData
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	RMassBank_2.8.0.tar.gz
Windows二进制	RMassBank_2.8.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	RMassBank_2.8.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/RMassBank
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RMassBank
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RMassBank/
软件包下载报告	下载数据