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RJMCMCNucleosomes
DOI:10.18129 / B9.bioc.RJMCMCNucleosomes
此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见RJMCMCNucleosomes．
具有高通量短读数据的全基因组核小体定位贝叶斯层次模型(MNase-Seq)
Bioconductor版本:3.7
该包使用信息性多-狄利克雷先验t混合进行核小体定位，并对核小体位置进行可逆跳跃估计，用于全基因组分析。
作者:Pascal Belleau [aut]， Rawane Samb [aut]， Astrid Deschênes [cre, aut]， Khader Khadraoui [aut]， Lajmi Lakhal-Chaieb [aut]， Arnaud Droit [aut]
维护者:Astrid Deschênes
引文(从R内，输入引用(“RJMCMCNucleosomes”))：
安装
要安装这个包，启动R并输入:
##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“RJMCMCNucleosomes”)
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“RJMCMCNucleosomes”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 核小体定位 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，BiologicalQuestion，ChIPSeq，报道，NucleosomePositioning，测序，软件，StatisticalMethod |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(1.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.4)，IRanges，GenomicRanges |
| 进口 | Rcpp(> = 0.12.5),consensusSeekeR，BiocGenerics，GenomeInfoDb，S4Vectors，BiocParallel，统计，图形，方法，grDevices |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，nucleoSim，RUnit |
| SystemRequirements | Rcpp |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/ArnaudDroitLab/RJMCMCNucleosomes |
| BugReports | https://github.com/ArnaudDroitLab/RJMCMCNucleosomes/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RJMCMCNucleosomes_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RJMCMCNucleosomes_1.4.0.zip(32位和64位) |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RJMCMCNucleosomes_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RJMCMCNucleosomes |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RJMCMCNucleosomes |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RJMCMCNucleosomes/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
