Polyfit

DOI:10.18129 / B9.bioc.Polyfit

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见Polyfit

添加到DESeq,以提高p值和q值

Bioconductor版本:3.7

Polyfit是包DESeq的一个附加组件,它确保p值在区间[0,1]上的分布是均匀的,对于满足无差分表达式的零假设的数据,并使用一种适应的story - tibshiran方法来计算q值。

作者:康拉德·伯顿

维护者:Conrad Burden < Conrad。负担在anu.edu.au>

引文(从R内,输入引用(“Polyfit”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持来源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“Polyfit”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“Polyfit”)

PDF R脚本 Polyfit
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionRNASeq测序软件
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(四年)
许可证 GPL (>= 3)
取决于 DESeq
进口
链接
建议 BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Polyfit_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Polyfit_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Polyfit_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Polyfit
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Polyfit
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Polyfit/
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