PGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PGSEA

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本,请参见PGSEA

参数基因集富集分析

Bioconductor版本:3.7

基因集富集的参数分析

作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

维护者:Karl Dykema < Karl。Dykema在vai.org>

引文(从R内,输入引用(“PGSEA”)):

安装

要安装这个包,启动R并输入:

##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“PGSEA”)

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PGSEA”)

PDF R脚本 HOWTO: PGSEA
PDF R脚本 PGSEA示例工作流
PDF 参考手册

细节

biocViews 微阵列软件
版本 1.54.0
在Bioconductor BioC 2.0 (R-2.5)(11.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),GO.dbKEGG.dbAnnotationDbiannaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5)
进口
链接
建议 GSEABaseGEOqueryorg.Hs.eg.dbhgu95av2.dblimma
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 GeneExpressionSignature
进口我
建议我 gskb
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PGSEA_1.54.0.tar.gz
Windows二进制 PGSEA_1.54.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) PGSEA_1.54.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PGSEA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/
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Bioconductor

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网