该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅PAA。
生物导体版本:3.7
PAA导入已保存在GPR文件格式的单色(蛋白质)微阵列数据-ESP。原始阵列数据。预处理后(背景校正,批处理过滤,归一化)单变量特征预选(例如,使用“最小M统计”方法 - 以下简称为“ MMS”)。随后,进行了多元特征选择以发现生物标志物候选物。因此,可以使用基于频率的向后消除侵犯或合奏特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱,其中包括几个不同的图,用于检查和评估。
作者:Michael Turewicz [AUT,CRE],Martin Eisenacher [CTB,CRE]
维护者:Michael Turewicz
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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ paa”)
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R脚本 | PAA教程 | |
paa_1.7.1.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 分类,,,,微阵列,,,,Onechannel,,,,蛋白质组学,,,,软件 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(4年) |
执照 | BSD_3_Clause +文件许可证 |
要看 | r(> = 3.2.0),RCPP(> = 0.11.6) |
进口 | E1071,,,,GPLOTS,,,,gtools,,,,林玛,,,,大量的,,,,Mrmre,,,,Randomforest,,,,rocr,,,,SVA |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,运行,,,,生物基因,,,,VSN |
系统要求 | C ++软件包随机丛林 |
增强 | |
URL | http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/paa/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | paa_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | paa_1.14.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | paa_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/paa |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/paa |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/paa/ |
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