NanoStringQCPro

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringQCPro

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见NanoStringQCPro．

NanoString mRNA基因表达数据的质量度量和数据处理方法

Bioconductor版本:3.7

NanoStringQCPro提供了一套质量指标，可用于评估NanoString mRNA基因表达数据的质量，即识别异常值探针和异常值样本。它还为这些数据提供了不同的背景减法和归一化方法。它输出标记样本/探测的建议和易于共享的html质量控制输出。

作者:Dorothee Nickles < Nickles。dorothee at gene.com>， Thomas Sandmann < Sandmann。托马斯在gene.com>，罗伯特齐曼<齐曼。罗伯特在gene.com>，Richard Bourgon

维护者:Robert Ziman < Ziman。罗伯特在gene.com>

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“NanoStringQCPro”)

文档

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PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列，归一化，预处理，质量控制，ReportWriting，软件，mRNAMicroarray
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(3.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.2)，方法
进口	AnnotationDbi(> = 1.26.0),org.Hs.eg.db(> = 2.14.0),Biobase(> = 2.24.0),knitr(> = 1.12),NMF(> = 0.20.5),RColorBrewer(> = 1.0 5),png(> = 0.1 7)
链接
建议	roxygen2(> = 4.0.1),testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	NanoStringQCPro_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringQCPro_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	NanoStringQCPro_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringQCPro
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringQCPro
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringQCPro/
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