NanoStringDiff

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringDiff

此包适用于Bioconductor的3.7版;有关稳定的、最新的发布版本，请参见NanoStringDiff。

NanoString nCounter数据的差异表达分析

Bioconductor版本:3.7

该包利用负二项族的广义线性模型(GLM)来描述计数数据，并允许进行多因素设计。在模型框架中，NanoStrongDiff结合了大小因子(由正控件和管家控件计算)和背景级别(由负控件计算)，从而充分利用了NanoString nCounter Analyzer提供的所有标准化信息。

作者:王红<红。王在uky.edu >,tingting zhai , chi wang

维护者:翟婷婷<婷婷。翟在uky.edu>，王红<红。王在uky.edu >

安装

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PDF	R脚本	NanoStringDiff装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,归一化,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (R-3.2)(3年)
许可证	GPL
取决于	Biobase
进口	matrixStats、方法、Rcpp
链接	Rcpp
建议	testthat,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	NanoStringDiff_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringDiff_1.10.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	NanoStringDiff_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringDiff
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringDiff
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringDiff/
包下载报告	下载数据