ngscopy

doi:10.18129/b9.bioc.ngscopy

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅ngscopy

NGSCOPY:检测下一代测序测序中拷贝数变化

生物导体版本:3.7

NGScopy提供了一个定量呼叫者,用于检测下一代测序(NGS)中的拷贝数变化,包括整个基因组测序(WGS),整个外显子组测序(WES)和目标面板测序(TPS)。可以通过染色体并行将呼叫者在一台计算机上使用多个处理器/内核。

作者:小佐比[AUT,CRE,CPH]

维护者:xiaobei zhao

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PDF R脚本 NGSCOPY:检测下一代测序中拷贝数变化(用户指南)
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,测序,,,,软件,,,,目标征服,,,,全媒体
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(4年)
执照 GPL(> = 2)
要看 R(> = 3.1.0)
进口 方法,并行,xmisc(> = 0.2.1),rbamtools(> = 2.6.0),更改点(> = 2.1.1)
链接
建议 运行,,,,ngscopydata,,,,基因组机
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 ngscopy_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 ngscopy_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) ngscopy_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngscopy
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/ngscopy
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ngscopy/
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