该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅ngscopy。
生物导体版本:3.7
NGScopy提供了一个定量呼叫者,用于检测下一代测序(NGS)中的拷贝数变化,包括整个基因组测序(WGS),整个外显子组测序(WES)和目标面板测序(TPS)。可以通过染色体并行将呼叫者在一台计算机上使用多个处理器/内核。
作者:小佐比[AUT,CRE,CPH]
维护者:xiaobei zhao
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R脚本 | NGSCOPY:检测下一代测序中拷贝数变化(用户指南) | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 库务,,,,dnaseq,,,,Exomeseq,,,,测序,,,,软件,,,,目标征服,,,,全媒体 |
版本 | 1.14.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.0(R-3.1)(4年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | R(> = 3.1.0) |
进口 | 方法,并行,xmisc(> = 0.2.1),rbamtools(> = 2.6.0),更改点(> = 2.1.1) |
链接 | |
建议 | 运行,,,,ngscopydata,,,,基因组机 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | ngscopy_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | ngscopy_1.14.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | ngscopy_1.14.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ngscopy |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/ngscopy |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/ngscopy/ |
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