mutationalpatterns.

DOI：10.18129 / b9.bioc.mutationalpatterns.

此套餐适用于Biocumonds 3.7版;对于稳定的最新版本版本，请参阅mutationalpatterns.。

综合基因组突变分析突变过程

生物导体版本：3.7

广泛的工具集，用于在基础替代目录中的各种突变模式的表征和可视化。

作者：Francis Blokzijl，Roel Janssen，Ruben Van Boxtel，Edwin Cuppen

维护者：Francis Blokzijl ，Roel Janssen

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PDF.	r script.	MutationalPatterns介绍
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文本		执照

细节

Biocviews.	遗传学那软件那躯体责任
版本	1.6.1.
在生物导体中以来	BIOC 3.4（R-3.3）（2年）
执照	MIT +文件许可证
依靠	r（> = 3.4.0），Genomicranges.（> = 1.24.0），NMF.（> = 0.20.6）
进口	统计数据，平行，S4Vectors.那生物根系（> = 0.18.0），VariantAnnotation.（> = 1.18.1），重塑2.（> = 1.4.1），普利尔（> = 1.8.3），ggplot2.（> = 2.1.0），Pracma.（> = 1.8.8），概括分析（> = 1.2.2），绞喉（> = 2.6.0），Genomeinfodb.（> = 1.12.0），生物仪器（> = 2.40.0），ggdendro（> = 0.1-20），电台（> = 0.9.2）
链接到
建议	bsgenome.（> = 1.40.0），bsgenome.hsapiens.1000Genomes.HS37D5（> = 0.99.1），bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.（> = 1.4.0），生物焦（> = 2.0.3），txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.（> = 3.2.2），生物雕（> = 2.28.0），格拉底（> = 2.2.1），rtracklayer.（> = 1.32.2），testthat.
系统要求
加强
URL.	https://doi.org/10.1186/s13073-018-0539-0
取决于我
进口我
建议我
链接给我
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包档案包

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源包	mutationalpatterns_1.6.1.tar.gz.
Windows二进制文件	mutationalpatterns_1.6.1.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	mutationalpatterns_1.6.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/mutationalpatterns.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ umattern
包短网址	http://biocidodder.org/packages/mutationalpatterns/
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