MotifDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.MotifDb

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见MotifDb．

蛋白质- dna结合序列基序注释集

Bioconductor版本:3.7

来自14个公共来源的超过9000个注释的位置频率矩阵，用于多种生物。

作者:保罗·香农，马特·理查德

维护者:Paul Shannon

安装

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文档

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PDF	R脚本	% % MotifDb概述
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	MotifAnnotation，软件
版本	1.22.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(6年)
许可证	artist -2.0 |文件许可
取决于	R(>= 2.15.0)，方法，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，Biostrings
进口	rtracklayer，splitstackshape
链接
建议	RUnit，seqLogo，MotIV
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	generegulation，motifbreakR，trena
进口我	rTRMui
建议我	ATACseqQC，DiffLogo，MMDiff2，motifcounter，motifStack，profileScoreDist，PWMEnrich，rTRM，vtpnet
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MotifDb_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	MotifDb_1.22.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MotifDb_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MotifDb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MotifDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MotifDb/
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