MineICA

DOI:10.18129 / B9.bioc.MineICA

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见MineICA．

对基因组学数据进行ICA分解分析

Bioconductor版本:3.7

MineICA的目标是对多个转录组数据集进行独立成分分析(ICA)，整合其他数据(如分子数据、临床数据和病理数据)。这种综合ICA通过研究它们与变量(例如样本注释)和基因集的关联来帮助对成分进行生物学解释，并能够使用基于相关性的图来比较来自不同数据集的成分。

作者:安妮·比顿

维护者:Anne Biton < Anne。Biton在gmail.com>

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PDF	R脚本	基因组数据的独立成分分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	MultipleComparison，软件，可视化
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 2.12 (R-3.0)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R(>= 2.10)，方法，BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase，plyr，ggplot2，尺度，foreach，xtable，biomaRt，gtools，GOstats，集群，marray，mclust，RColorBrewer，色彩，igraph，Rgraphviz，图，注释，Hmisc，fastICA，玉
进口	AnnotationDbi，光民，fpc，lumiHumanAll.db
链接
建议	biomaRt，GOstats，集群，hgu133a.db，mclust，igraph，breastCancerMAINZ，breastCancerTRANSBIG，breastCancerUPP，breastCancerVDX
SystemRequirements
增强了	doMC
URL
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包档案

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源包	MineICA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	MineICA_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MineICA_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MineICA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MineICA/
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