母子

doi:10.18129/b9.bioc.matrixrider

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅母子

在给定序列上获得结合位点矩阵的总亲和力和占用

生物导体版本:3.7

为整个序列计算一个数字,该数字反映了DNA结合蛋白与其相互作用的倾向。DNA结合蛋白必须用PFM基质来描述,例如从Jaspar获得。

作者:Elena Grassi

维护者:elena grassi

引用(从r内,输入引用(“ matrixrider”)):

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PDF R脚本 总亲和力和占领
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结肠管制,,,,遗传学,,,,图案,,,,软件
版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(3.5岁)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.1.2)
进口 方法,TFBSTOOLS,,,,iranges,,,,xvector,,,,生物弦
链接 iranges,,,,xvector,,,,生物弦,,,,S4VECTORS
建议 运行,,,,生物基因,,,,生物使用,,,,Jaspar2014
系统要求
增强
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建议我
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源包 matrixrider_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 matrixrider_1.12.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) matrixrider_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/matrixrider
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/matrixrider
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/matrixrider/
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