MSGFplus

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSGFplus

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSGFplus

R和MS-GF +之间的接口

Bioconductor版本:3.7

这个包包含函数执行肽识别使用MS-GF +算法。包包含的功能建立一个参数集的代码,并通过一个简单的GUI,以及批量运行算法,潜在的异步。

作者:托马斯·彼得森林

维护人员:林托马斯·皮德森< thomasp85 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“MSGFplus”)):

安装

安装这个包,开始R和输入:

# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite (“MSGFplus”)

文档

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HTML R脚本 使用MSGFgui
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文本 新闻

细节

biocViews MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本 1.14.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(4年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 方法
进口 mzID,ProtGenerics
链接
建议 gWidgets,knitr,testthat
SystemRequirements Java (> = 1.7)
增强了
URL
取决于我 蛋白质组学
进口我 MSGFgui
建议我 RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 MSGFplus_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 MSGFplus_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) MSGFplus_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSGFplus
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSGFplus
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSGFplus/
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Bioconductor

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网