米拉

doi:10.18129/b9.bioc.mira

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅米拉

基于甲基化调节活性的推断

生物导体版本:3.7

MIRA测量围绕感兴趣的调节位点(例如转录因子结合位点)的甲基化水平的“浸入”程度,以跨基因组进行该类型的位点的实例,然后可用于推断调节活性。

作者:内森·谢菲尔德

维护者:约翰·劳森(John Lawson)

引用(从r内,输入引用(“ Mira”)):

安装

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文档

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html R脚本 将mira应用于生物学问题
html R脚本 从基于甲基化的调节活动推断开始
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,功能基因组学,,,,结肠管制,,,,基因数,,,,甲基,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学
版本 1.2.0
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.4)
进口 生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Data.Table,,,,GGPLOT2,,,,生物酶,统计BSSEQ, 方法
链接
建议 尼特, 平行,测试,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,AnnotationHub,,,,萝拉
系统要求
增强
URL http://databio.org/mira
BugReports https://github.com/databio/mira
取决于我
进口我
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构建报告

包装档案

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源包 mira_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 mira_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) mira_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mira
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mira
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mira/
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