该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅米拉。
生物导体版本:3.7
MIRA测量围绕感兴趣的调节位点(例如转录因子结合位点)的甲基化水平的“浸入”程度,以跨基因组进行该类型的位点的实例,然后可用于推断调节活性。
作者:内森·谢菲尔德
维护者:约翰·劳森(John Lawson)
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html | R脚本 | 将mira应用于生物学问题 |
html | R脚本 | 从基于甲基化的调节活动推断开始 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | chipseq,,,,覆盖范围,,,,DNAMETHYLATY,,,,表观遗传学,,,,功能基因组学,,,,结肠管制,,,,基因数,,,,甲基,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | 生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Data.Table,,,,GGPLOT2,,,,生物酶,统计BSSEQ, 方法 |
链接 | |
建议 | 尼特, 平行,测试,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,AnnotationHub,,,,萝拉 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | http://databio.org/mira |
BugReports | https://github.com/databio/mira |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mira_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | mira_1.2.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | mira_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mira |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mira |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mira/ |
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