冰雹

DOI：10.18129 / b9.bioc.medips.

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DNA IP-SEQ数据分析

生物导体版本：3.7

开发了用于分析衍生自甲基化DNA免疫沉淀（MedIP）实验的数据，然后进行测序（MedIP-SEQ）。然而，Medips提供了分析任何类型的定量测序数据（例如芯片-SEQ，MBD-SEQ，CMS-SEQ，CMS-SEQ，其他）的功能，包括计算样品和饱和和饱和分析组之间的差分覆盖。

作者：Lukas Chavez，Matthias Lienhard，Joern Dietrich，Isaac Lopez Moyado

维护者：Lukas Chavez

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细节

Biocviews.	chipseq.那复印机那覆盖范围那CPGISLAND那德甲基化那不同的亚兴那遗传学那GenomeanNotation.那微阵列那预处理那QualityControl.那序列术那测序那软件那可视化
版本	1.32.0
在生物导体中以来	BIOC 2.7（R-2.12）（8年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.0），bsgenome.那RSAMTOOLS.
进口	Genomicranges.那生物仪器，图形，GTOOLS.那绞喉，方法，统计数据，utils，edger.那dnacopy.那生物雕那rtracklayer.那预处理核
链接到
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那medipsdata.那生物焦
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源包	medips_1.32.0.tar.gz.
Windows二进制文件	medips_1.32.0.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	medips_1.32.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/medive.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包/发音
包短网址	http://biocidodder.org/packages/medive/medive/
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