MAGeCKFlute

DOI:10.18129 / B9.bioc.MAGeCKFlute

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见MAGeCKFlute．

整合分析管道汇集CRISPR功能遗传筛选

Bioconductor版本:3.7

MAGeCKFlute设计用于支持下游分析，利用MAGeCK或MAGeCK- vispr提供的基因汇总数据。在流水线上对CRISPR屏幕数据进行质量控制、归一化和屏幕命中识别。在管道中识别的命中基于实验设计进行分类，随后通过功能富集分析进行解释。

作者:张武兵，吴飞珍，王彬彬

维护者:Wubing Zhang

安装

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文档

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超文本标记语言	R脚本	MAGeCKFlute。限制型心肌病
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文本		新闻

细节

biocViews	CRISPR，FunctionalGenomics，GeneSetEnrichment，MultipleComparison，归一化，通路，PooledScreens，质量控制，软件，可视化，工作流
版本	1.0.1
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (>= 3.5)，ggplot2，统计，grDevices, utils，pathview，gridExtra
进口	ggExtra，ggsci，ggrepel，clusterProfiler，png，data.table，pheatmap，RColorBrewer，股东价值分析，GOstats，类别，剂量，biomaRt、网格
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，org.Mm.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

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源包	MAGeCKFlute_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	MAGeCKFlute_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MAGeCKFlute_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MAGeCKFlute
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MAGeCKFlute
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MAGeCKFlute/
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