M3D

DOI:10.18129 / B9.bioc.M3D

此包适用于Bioconductor 3.7版;有关稳定的最新发布版本，请参见M3D．

在测试组中识别不同甲基化区域

Bioconductor版本:3.7

该包可以在统计学上显著地识别CpGs的甲基化差异区域。它使用核方法(最大平均差异)来测量甲基化谱的差异，并将这些差异与复制间的变化联系起来，同时考虑覆盖谱的变化。

作者:汤姆·梅奥

维护人员:Tom Mayo

安装

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##尝试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”)biocLite(“M3D”)

文档

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PDF	R脚本	M$^3$D方法简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，CpGIsland，DNAMethylation，DifferentialMethylation，软件
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.0 (R-3.1)(四年)
许可证	艺术许可2.0
取决于	R (>= 3.3.0)
进口	平行,Rcpp，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment，BiSeq
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	M3D_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	M3D_1.14.0.zip(64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	M3D_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/M3D
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/M3D
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/M3D/
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