萝拉

doi:10.18129/b9.bioc.lola

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅萝拉

基因座重叠分析,以富集基因组范围

生物导体版本:3.7

提供了测试与公共和自定义区域集(基因组范围)数据库的基因组区域集重叠的功能。这使得可以对基因组区域集进行自动富集分析,从而促进对功能基因组学和表观基因组学数据的解释。

作者:内森·谢菲尔德

维护者:Nathan Sheffield

引用(从r内,输入引用(“萝拉”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// URL不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ lola”)

文档

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html R脚本 1.萝拉开始
html R脚本 2.使用Lola Core
html R脚本 3.选择宇宙
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 chipseq,,,,功能基因组学,,,,结肠管制,,,,基因烯,,,,基因数,,,,甲基,,,,测序,,,,软件,,,,系统生物学
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(3年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.10)
进口 生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Data.Table,,,,RESHAPE2,utils,统计,方法
链接
建议 平行,测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown
系统要求
增强 SimpleCache,,,,QVALUE,,,,GGPLOT2
URL http://code.databio.org/lola
BugReports http://github.com/nsheff/lola
取决于我
进口我
建议我 深布鲁尔,,,,米拉
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 lola_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 lola_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) lola_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lola
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/萝拉
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/lola/
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