同工型间分析仪

doi:10.18129/b9.bioc.isoformswitchanalyzer

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅同工型间分析仪

R包来识别,注释和可视化具有功能后果的同工型开关(来自RNA-Seq数据)

生物导体版本:3.7

通过Kallisto,Salmon,Cufflinks/Cuffdiff,RSEM等,可以鉴定和分析具有预测功能后果(例如蛋白质结构域等的增益/蛋白质结构域等)的同工型开关的识别和分析。

作者:Kristoffer Vitting-seerup

维护者:kristoffer vitting-seerup

引用(从r内,输入引用(“ Isoformswitchanalyzer”)):

安装

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html R脚本 同工型间分析仪
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文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,注解,,,,生物医学信息学,,,,DataImport,,,,差异性,,,,差速器,,,,功能基因组学,,,,功能性预测,,,,基因表达,,,,遗传,,,,多重组合,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,系统生物学,,,,转录,,,,转录组变量,,,,转录组学,,,,可视化
版本 1.2.0
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.4),腹带
进口 方法,BSGENOME,,,,plyr,,,,RESHAPE2,,,,栅格,,,,生物弦,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Drimseq,,,,rcolorbrewer,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,Venndiagram,,,,DBI,grdevices,图形,统计,utils,GenomeInfodB, 网格,tximport,,,,EDGER,,,,徒劳
链接
建议 尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19
系统要求
增强
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/isoformswitchanalyzer/
BugReports https://github.com/kvittingseerup/isoformswitchanalyzer/issues
取决于我
进口我
建议我
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源包 isoformswitchanalyzer_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 Isoformswitchanalyzer_1.2.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Isoformswitchanalyzer_1.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isoformswitchanalyzer
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/isoformswitchanalyzer
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/isoformswitchanalyzer/
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