该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅同工型间分析仪。
生物导体版本:3.7
通过Kallisto,Salmon,Cufflinks/Cuffdiff,RSEM等,可以鉴定和分析具有预测功能后果(例如蛋白质结构域等的增益/蛋白质结构域等)的同工型开关的识别和分析。
作者:Kristoffer Vitting-seerup
维护者:kristoffer vitting-seerup
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html | R脚本 | 同工型间分析仪 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 替代方案,,,,注解,,,,生物医学信息学,,,,DataImport,,,,差异性,,,,差速器,,,,功能基因组学,,,,功能性预测,,,,基因表达,,,,遗传,,,,多重组合,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件,,,,统计信息,,,,系统生物学,,,,转录,,,,转录组变量,,,,转录组学,,,,可视化 |
版本 | 1.2.0 |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.4),腹带 |
进口 | 方法,BSGENOME,,,,plyr,,,,RESHAPE2,,,,栅格,,,,生物弦,,,,iranges,,,,基因组机,,,,Drimseq,,,,rcolorbrewer,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,Venndiagram,,,,DBI,grdevices,图形,统计,utils,GenomeInfodB, 网格,tximport,,,,EDGER,,,,徒劳 |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/isoformswitchanalyzer/ |
BugReports | https://github.com/kvittingseerup/isoformswitchanalyzer/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | isoformswitchanalyzer_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | Isoformswitchanalyzer_1.2.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Isoformswitchanalyzer_1.2.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isoformswitchanalyzer |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/isoformswitchanalyzer |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/isoformswitchanalyzer/ |
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