irisspatialFeatures

doi:10.18129/b9.bioc.irisspatialfeatures

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅irisspatialFeatures

如果图像

生物导体版本:3.7

iRisspatialFeatures读取Perkinelmer信息软件的输出,并计算出各种空间统计。除了简单的计数外,它还可以为每个细胞类型提供平均最近的邻居,并为每个细胞类型提供相互作用的摘要曲线。这些统计数据均跨图像得出,无论用户定义的蒙版所定义的整体和感兴趣的区域。

作者:Daniel Gusenleitner,Jason L. Weirather

维护者:Daniel Gusenleitner

引用(从r内,输入引用(“ irisspatialFeatures”)):

安装

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细节

生物浏览 特征提取,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.3.0
执照 麻省理工学院 +文件许可证
要看 R(> = 3.4)
进口 RCPP(> = 0.12.7),海上工具,,,,GPLOTS,,,,spatstat,,,,tiff,,,,rcolorbrewer,方法,grdevices,图形,统计,utils,Data.Table,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,蒂布尔
链接 RCPP
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
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源包 irisspatialfeatures_1.3.0.tar.gz
Windows二进制 irisspatialFeatures_1.3.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) irisspatialFeatures_1.3.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/irisspatialfeatures
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/irisspatialfeatures
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/irisspatialfeatures/
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