该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅irisspatialFeatures。
生物导体版本:3.7
iRisspatialFeatures读取Perkinelmer信息软件的输出,并计算出各种空间统计。除了简单的计数外,它还可以为每个细胞类型提供平均最近的邻居,并为每个细胞类型提供相互作用的摘要曲线。这些统计数据均跨图像得出,无论用户定义的蒙版所定义的整体和感兴趣的区域。
作者:Daniel Gusenleitner,Jason L. Weirather
维护者:Daniel Gusenleitner
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R脚本 | 小插图标题 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 特征提取,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.3.0 |
执照 | 麻省理工学院 +文件许可证 |
要看 | R(> = 3.4) |
进口 | RCPP(> = 0.12.7),海上工具,,,,GPLOTS,,,,spatstat,,,,tiff,,,,rcolorbrewer,方法,grdevices,图形,统计,utils,Data.Table,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,马格里特,,,,蒂布尔 |
链接 | RCPP |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | irisspatialfeatures_1.3.0.tar.gz |
Windows二进制 | irisspatialFeatures_1.3.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | irisspatialFeatures_1.3.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/irisspatialfeatures |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/irisspatialfeatures |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/irisspatialfeatures/ |
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