互动集

doi:10.18129/b9.bioc.intractionset

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅互动集

存储基因组相互作用数据的基础类

生物导体版本:3.7

提供Ginteractions,Intercontionset和Contactionset和Contactmatrix对象以及相关的方法,用于存储和操纵HI-C和CHIA-PET实验的基因组相互作用数据。

作者:Aaron Lun ,Malcolm Perry ,liz ing-simmons

维护者:aaron lun

引用(从r内,输入引用(“ Interactionset”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ https://www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ Interactionset”)

文档

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browsevignettes(“ Interactionset”)

html R脚本 与基因组相互作用数据的相互作用集相互作用
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.8.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.5),基因组机,,,,总结性特征
进口 iranges,,,,S4VECTORS(> = 0.17.21),GenomeInfodB,,,,生物基因, 方法,矩阵,,,,RCPP
链接 RCPP
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求 C ++ 11
增强
URL
取决于我 Diffhic,,,,基因组间,,,,Macpet,,,,塞文
进口我 Hiccompare,,,,TrackViewer
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Interactionset_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 Interactionset_1.8.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) Interactionset_1.8.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactionset
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/互动集
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/interactionset/
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