该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅互动集。
生物导体版本:3.7
提供Ginteractions,Intercontionset和Contactionset和Contactmatrix对象以及相关的方法,用于存储和操纵HI-C和CHIA-PET实验的基因组相互作用数据。
作者:Aaron Lun
维护者:aaron lun
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html | R脚本 | 与基因组相互作用数据的相互作用集相互作用 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,嗝,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.3(R-3.3)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.5),基因组机,,,,总结性特征 |
进口 | iranges,,,,S4VECTORS(> = 0.17.21),GenomeInfodB,,,,生物基因, 方法,矩阵,,,,RCPP |
链接 | RCPP |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用 |
系统要求 | C ++ 11 |
增强 | |
URL | |
取决于我 | Diffhic,,,,基因组间,,,,Macpet,,,,塞文 |
进口我 | Hiccompare,,,,TrackViewer |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Interactionset_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | Interactionset_1.8.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | Interactionset_1.8.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/interactionset |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/互动集 |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/interactionset/ |
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