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首次公开募股
DOI:10.18129 / B9.bioc.IPO
这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅首次公开募股。
XCMS数据处理参数的自动优化
Bioconductor版本:3.7
XCMS数据处理的结果很大程度上取决于参数设置。IPO (“Isotopologue参数优化”)是一个参数优化工具,适用于不同类型的样本和液相色谱与高分辨率质谱装置,快速和无标签的步骤。IPO使用自然、稳定的13 c同位素峰值计算分数。保留时间校正优化通过最小化的相对保留时间差异特性和分组参数优化通过最大化功能显示一个峰的数量从每个注入的样品池。不同的参数设置是通过实验设计来实现。利用响应面模型所得的分数评价。
作者:贡纳Libiseller <贡纳。Libiseller joanneum。>,Christoph磁石,<克里斯托弗。在joanneum磁石。托马斯Riebenbauer < >。在joanneum.at Riebenbauer >
维护人员:托马斯Riebenbauer <托马斯。在joanneum.at Riebenbauer >
从内部引用(R,回车引用(“上市”)):
安装
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# #试试http://如果https:// url不支持源(“//www.anjoumacpherson.com/biocLite.R”) biocLite(“上市”)
文档
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| HTML | R脚本 | XCMS参数优化与IPO(首次公开募股) |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | MassSpectrometry,代谢组学,软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(2年) |
| 许可证 | GPL许可证(> = 2)+文件 |
| 取决于 | xcms(> = 1.50.0),rsm,相机、grDevices图形、属性、跑龙套 |
| 进口 | BiocParallel |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,msdata,mtbls2,faahKO,knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | 平行 |
| URL | https://github.com/rietho/IPO |
| BugReports | https://github.com/rietho/IPO/issues/new |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | IPO_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | IPO_1.6.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | IPO_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IPO |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IPO(首次公开募股) |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/IPO/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
