首次公开募股

DOI:10.18129 / B9.bioc.IPO

这个包是3.7版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅首次公开募股

XCMS数据处理参数的自动优化

Bioconductor版本:3.7

XCMS数据处理的结果很大程度上取决于参数设置。IPO (“Isotopologue参数优化”)是一个参数优化工具,适用于不同类型的样本和液相色谱与高分辨率质谱装置,快速和无标签的步骤。IPO使用自然、稳定的13 c同位素峰值计算分数。保留时间校正优化通过最小化的相对保留时间差异特性和分组参数优化通过最大化功能显示一个峰的数量从每个注入的样品池。不同的参数设置是通过实验设计来实现。利用响应面模型所得的分数评价。

作者:贡纳Libiseller <贡纳。Libiseller joanneum。>,Christoph磁石,<克里斯托弗。在joanneum磁石。托马斯Riebenbauer < >。在joanneum.at Riebenbauer >

维护人员:托马斯Riebenbauer <托马斯。在joanneum.at Riebenbauer >

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HTML R脚本 XCMS参数优化与IPO(首次公开募股)
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews MassSpectrometry,代谢组学,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(2年)
许可证 GPL许可证(> = 2)+文件
取决于 xcms(> = 1.50.0),rsm,相机、grDevices图形、属性、跑龙套
进口 BiocParallel
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,msdata,mtbls2,faahKO,knitr
SystemRequirements
增强了 平行
URL https://github.com/rietho/IPO
BugReports https://github.com/rietho/IPO/issues/new
取决于我
进口我
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包档案

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源包 IPO_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 IPO_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) IPO_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IPO
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IPO(首次公开募股)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/IPO/
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