HITC

doi:10.18129/b9.bioc.hitc

该包适用于生物导体的3.7版;对于稳定的最新版本,请参阅HITC

高通量染色体构象捕获分析

生物导体版本:3.7

开发了HITC软件包,以探索高通量“ C”数据,例如5C或HI-C。还提供了专用的R类以及质量控制,标准化,可视化和进一步分析的标准方法。

作者:尼古拉斯仆人

维护者:尼古拉斯仆人

引用(从r内,输入引用(“ HITC”)):

安装

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##尝试http://如果不支持https:// url不支持源(“ //www.anjoumacpherson.com/bioclite.r”)bioclite(“ hitc”)

文档

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PDF R脚本 HI-C数据分析使用HITC
PDF R脚本 HITC包装简介
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,高通量序列,,,,测序,,,,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(6。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.15.0),方法,iranges,,,,基因组机
进口 生物弦,图形,grdevices,rtracklayer,,,,rcolorbrewer,,,,矩阵, 平行,GenomeInfodB
链接
建议 生物使用,,,,Hicdatahumanimr90
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Hicdatahumanimr90
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 hitc_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 hitc_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) hitc_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hitc
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/hitc
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/hitc/
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